RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POLLQ9UGP5 575 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ERVK-11Q9UQG0 969 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 YIPF1Q9Y548 306 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WIF1Q9Y5W5 379 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CAPN7Q9Y6W3 813 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 G3V2L1 256 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PIP5K1BO14986 540 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ASNA1O43681 348 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DFFBO76075 338 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GCNT3O95395 438 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SEC24AO95486 1093 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZBED1O96006 694 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGLV1-47P01700 117 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PNMTP11086 282 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SERPINA4P29622 427 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OAS2P29728 719 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MEOX2P50222 304 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NEK2P51955 445 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CRISP1P54107 249 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 STX17P56962 302 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CSNK2BP67870 215 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SORDQ00796 357 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRKCZQ05513 592 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PSG7Q13046 419 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDCLQ13371 301 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NAE1Q13564 534 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BLMHQ13867 455 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF146Q15072 292 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPS6KA2Q15349 733 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TAF13Q15543 124 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LTB4RQ15722 352 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C9orf66Q5T8R8 295 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SIGIRRQ6IA17 410 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PGBD2Q6P3X8 592 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KLC3Q6P597 504 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NOTUMQ6P988 496 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CORO6Q6QEF8 472 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LCLAT1Q6UWP7 414 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C17orf99Q6UX52 265 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KSR2Q6VAB6 950 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PQLC2Q6ZP29 291 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM160B2Q86V87 743 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBQLNLQ8IYU4 475 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF525Q8N782 197 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FSIP1Q8NA03 581 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR1J1Q8NGS3 322 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR4Q3Q8NH05 313 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GATAD1Q8WUU5 269 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GCC1Q96CN9 775 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNFT2Q96EX2 444 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC41A2Q96JW4 573 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAGEB18Q96M61 343 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WDFY2Q96P53 400 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DGAT2Q96PD7 388 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MYADMQ96S97 322 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM110AQ9BQ89 295 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 APOL5Q9BWW9 433 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LRRCC1Q9C099 1032 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NUP62CLQ9H1M0 184 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC32A1Q9H598 525 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLEKHA2Q9HB19 425 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARNT2Q9HBZ2 717 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACKR4Q9NPB9 350 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C1orf112Q9NSG2 853 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CD207Q9UJ71 328 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DAPP1Q9UN19 280 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ASTN1O14525 1302 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A1W2PN81 502 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF233A6NK53 670 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A8MV72 311 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRIM49D1C9J1S8 452 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ANKRD63C9JTQ0 380 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VCYO14598 125 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KPNA5O15131 536 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CBR3O75828 277 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VTNP04004 478 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PCP11498 1178 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CPN1P15169 458 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CA6P23280 308 aa-0.22□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms