RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 C9orf172C9J069 976 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAD51CO43502 376 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 S1PR4O95977 384 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 TSPAN7P41732 249 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSPA14Q0VDF9 509 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT33BQ14525 404 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 CRYMQ14894 314 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 BBS9Q3SYG4 887 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 IRGCQ6NXR0 463 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLHL35Q6PF15 583 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC22A15Q8IZD6 547 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 PMEPA1Q969W9 287 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 NRTNQ99748 197 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 B3GNT4Q9C0J1 378 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEMA5BQ9P283 1151 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACSL6Q9UKU0 697 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 SNX24Q9Y343 169 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 EFCAB7A8K855 629 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRAMEF10O60809 474 aa21.43■■□□□ 1.02
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IGHV3-20-201ENST00000390606 F7P08709 466 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 FMO4P31512 558 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRSS42Q7Z5A4 293 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDIK1LQ8N165 341 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR4E2Q8NGC2 313 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR52E1Q8NGJ3 308 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR5AR1Q8NGP9 310 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ASZ1Q8WWH4 475 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZDHHC12Q96GR4 267 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 TAAR9Q96RI9 348 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 HGH1Q9BTY7 390 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 FOXJ2Q9P0K8 574 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDC23Q9UJX2 597 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ASF1AQ9Y294 204 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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IGHV3-20-201ENST00000390606 NIPSNAP2O75323 286 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTC4O95801 387 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ESR1P03372 595 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 APOA4P06727 396 aa21.42■■□□□ 1.02
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IGHV3-20-201ENST00000390606 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D21Q8IYX1 336 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ART4Q93070 314 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERP44Q9BS26 406 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 NAT9Q9BTE0 207 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 HRASLS2Q9NWW9 162 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 TEX264Q9Y6I9 313 aa21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 H3BMM5 538 aa21.41■■□□□ 1.02
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IGHV3-20-201ENST00000390606 ITPKBP27987 946 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 ELK3P41970 407 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC1A2P43004 574 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 MC2RQ01718 297 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 CBLBQ13191 982 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPANXN3Q5MJ09 141 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 CACHD1Q5VU97 1274 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNMB4Q86W47 210 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPACA3Q8IXA5 215 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 CALML6Q8TD86 181 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 LCN9Q8WX39 176 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAP3K3Q99759 626 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC39A1Q9NY26 324 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 PKD1L2Q7Z442 2459 aa21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 BTN3A3O00478 584 aa21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-20-201ENST00000390606 RASSF9O75901 435 aa21.4■■□□□ 1.02
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