RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 PSMA3P25788 255 aa13.51□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 PRSS42Q7Z5A4 293 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 UBA3Q8TBC4 463 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.51□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 ANXA8P13928 327 aa13.51□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.253e-7■■■■□ 20.8
CTIF-202ENST00000382998 ANXA8L1Q5VT79 327 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 GPR139Q6DWJ6 353 aa13.51□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 ZSWIM9Q86XI8 627 aa13.51□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 TMEM117Q9H0C3 514 aa13.51□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 SPHK1Q9NYA1 384 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 ACKR2O00590 384 aa13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 MMP3P08254 477 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 CBWD6Q4V339 395 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 CBWD3Q5JTY5 395 aa13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 ACTL8Q9H568 366 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 FAM86C1Q9NVL1 165 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 GABRQQ9UN88 632 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 SPEF2Q9C093 1822 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 OR14I1A6ND48 311 aa13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 IFNA4P05014 189 aa13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 WSCD2Q2TBF2 565 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 PTPN20Q4JDL3 420 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 MFSD5Q6N075 450 aa13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 ACOT1Q86TX2 421 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 SLC35F3Q8IY50 421 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 LPPQ93052 612 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 WDR41Q9HAD4 459 aa13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 VAPBO95292 243 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 IFNA10P01566 189 aa13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 RNF224P0DH78 156 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 SLC16A13Q7RTY0 426 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 CFAP206Q8IYR0 622 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 FRS2Q8WU20 508 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 USP7Q93009 1102 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa13.5□□□□□ -0.25
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