RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PLCB1Q9NQ66 1216 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM22Q9P0K1 906 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP23Q9P227 1491 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 MRC2Q9UBG0 1479 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 MED23Q9ULK4 1368 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 NWD2Q9ULI1 1742 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 ALKQ9UM73 1620 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 A0A0J9YVX5 310 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 HTR3EA5X5Y0 456 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 E7EVH7 732 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 P4HA2O15460 535 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TTI1O43156 1089 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PEX11AO75192 247 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 ITGA2BP08514 1039 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TPBGLP0DKB5 382 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 CCNB1P14635 433 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PTPN2P17706 415 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 CMA1P23946 247 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 RYKP34925 604 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PNLIPRP1P54315 467 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 KLC1Q07866 573 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 BNIP1Q12981 228 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 BIRC3Q13489 604 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 MTF1Q14872 753 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 KARSQ15046 597 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 GSTA3Q16772 222 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 ERMARDQ5T6L9 678 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TRNP1Q6NT89 227 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 C16orf87Q6PH81 154 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF34Q8IZ26 560 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 BMPERQ8N8U9 685 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 FSIP1Q8NA03 581 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC63Q8NA47 563 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00301Q8NCQ3 95 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 KCNG4Q8TDN1 519 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 IFT81Q8WYA0 676 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 OTULINQ96BN8 352 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TLCD1Q96CP7 247 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 KXD1Q9BQD3 176 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 VCX3BQ9H321 246 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TLE6Q9H808 572 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 FKRPQ9H9S5 495 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 CERS4Q9HA82 394 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 RMND1Q9NWS8 449 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PDP2Q9P2J9 529 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 CACNG5Q9UF02 275 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 LRCH1Q9Y2L9 728 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TIMM22Q9Y584 194 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087WWV3 80 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 SERPINB7O75635 380 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 MYOD1P15172 320 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PORP16435 677 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TMOD1P28289 359 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 HOXC8P31273 242 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 KIF5BP33176 963 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TM4SF4P48230 202 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 HPCAP84074 193 aa3.55□□□□□ -1.84
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