RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF534Q76KX8 674 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 KMT5CQ86Y97 462 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 LCN9Q8WX39 176 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 EFHD1Q9BUP0 239 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 TLR10Q9BXR5 811 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 FER1L5A0AVI2 2057 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 HEATR9A2RTY3 570 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 GSAPA4D1B5 854 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 E7EVH7 732 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 KATNA1O75449 491 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 APRTP07741 180 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 PVRP15151 417 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCR10P46092 362 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCZ1BP86790 482 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACY1Q03154 408 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITIH4Q14624 930 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 PACS1Q6VY07 963 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 ELMO1Q92556 727 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 CATSPER2Q96P56 530 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM117AQ9C073 453 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 SRMSQ9H3Y6 488 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 LHX9Q9NQ69 397 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 AP2A2O94973 939 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ST6GAL1P15907 406 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDH3P22223 829 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 NSG1P42857 185 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRADDP78560 199 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACVR1Q04771 509 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABRQ12979 859 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNASE1L3Q13609 305 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ERV3-1Q14264 604 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 RANBP9Q96S59 729 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ICKQ9UPZ9 632 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 BTRCQ9Y297 605 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC175P0C221 793 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TPBGLP0DKB5 382 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADRA1DP25100 572 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNJ1P48048 391 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD151P48509 253 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPS18P62269 152 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TUBB4BP68371 445 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPA4Q13156 261 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TUBB2AQ13885 445 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 AFTPHQ6ULP2 937 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC89Q8N998 374 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PAK5Q9P286 719 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PADI1Q9ULC6 663 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPTA1P02549 2419 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC5A10A0PJK1 596 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCRG1O75711 98 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 FGGP02679 453 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACADLP28330 430 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CXCR5P32302 372 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRKAA1Q13131 559 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPS2Q13227 327 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCNG2Q16589 344 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRIM73Q86UV7 250 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 MVB12BQ9H7P6 319 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 IQCF5A8MTL0 148 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 SUV39H1O43463 412 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 GAS8O95995 478 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 FTH1P02794 183 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCNYL3P0C7X3 344 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 SFTPCP11686 197 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms