RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 FAM83EQ2M2I3 478 aa27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 LCA5Q86VQ0 697 aa27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 GATAD2AQ86YP4 633 aa27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 SPNS2Q8IVW8 549 aa27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 C12orf66Q96MD2 445 aa27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 EDEM2Q9BV94 578 aa27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 NLGN3Q9NZ94 848 aa27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
GIPC1-201ENST00000345425 FOXO6A8MYZ6 492 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL2O95198 593 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 ACADLP28330 430 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6V0D1P61421 351 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 IRF9Q00978 393 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CLCA4Q14CN2 919 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 IYDQ6PHW0 289 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CYHR1Q6ZMK1 362 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 PRR23CQ6ZRP0 262 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 NMRAL1Q9HBL8 299 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa27.14■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0G2JNG1 304 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 B4DGG1 531 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 KIR2DS3K7RE56 304 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 FFAR2O15552 330 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 MATN4O95460 622 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 EML2O95834 649 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CCNFP41002 786 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 ABRQ12979 859 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 KIR2DS5Q14953 304 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 UNC5DQ6UXZ4 953 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD4Q8WVF5 259 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 SMC6Q96SB8 1091 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 SH3GL2Q99962 352 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 PARD6AQ9NPB6 346 aa27.13■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 RPN2P04844 631 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CD1DP15813 335 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 KLC3Q6P597 504 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 SH2D5Q6ZV89 423 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CLEC14AQ86T13 490 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 NAGSQ8N159 534 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP61Q8NHU2 1237 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM9BQ9NQ34 198 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 ASF1AQ9Y294 204 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 FRYLO94915 3013 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 C8GP07360 202 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 SP140Q13342 867 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 RPE65Q16518 533 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 C4orf33Q8N1A6 199 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA6LQ8N4H0 392 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 AVL9Q8NBF6 648 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 NXNL1Q96CM4 212 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 IGSF5Q9NSI5 407 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 ACTL7BQ9Y614 415 aa27.12■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 OR52A4PA6NMU1 304 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 GSTA1P08263 222 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 GIMD1P0DJR0 217 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 GMPRP36959 345 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CCT5P48643 541 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 SLC18A2Q05940 514 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 DLG1Q12959 904 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 INAVAQ3KP66 663 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 AGBL2Q5U5Z8 902 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 OGFOD3Q6PK18 319 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 SFRP1Q8N474 314 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 OR4C6Q8NH72 309 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 ASB11Q8WXH4 323 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CXorf40BQ96DE9 158 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 DCDC2Q9UHG0 476 aa27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 BTN3A1O00481 513 aa27.1■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CATP04040 527 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 TGM1P22735 817 aa27.1■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 SLC14A1Q13336 389 aa27.1■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 ACAP2Q15057 778 aa27.1■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 MAPK15Q8TD08 544 aa27.1■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 PHOX2BQ99453 314 aa27.1■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa27.1■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC189A1A4V9 331 aa27.09■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 COPEO14579 308 aa27.09■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 SLC16A5O15375 505 aa27.09■■□□□ 1.93
GIPC1-201ENST00000345425 GLRA3O75311 464 aa27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms