RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLCD2A6NGC4 264 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCF5A8MTL0 148 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8KD6RF30 607 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 F8W8V4 182 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8TH3BQL2 631 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGIRP43119 386 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TYSND1Q2T9J0 566 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP40Q5TG30 622 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASC4Q6P4E1 433 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 VASH2Q86V25 355 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPIL6Q8IXY8 311 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT222Q8N1A0 295 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTUD6BQ8N6M0 293 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4E2Q8NGC2 313 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5AR1Q8NGP9 310 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBXN4Q92575 508 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC41A2Q96JW4 573 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP3K3Q99759 626 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARD6Q9BX69 1037 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPRY4Q9C004 299 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR70Q9NW82 654 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCYOX1Q9UHG3 505 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDYLQ9Y232 598 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAR1BQ9Y6B6 198 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTAGE9A4FU28 777 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDR42E2A6NKP2 422 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFSO43281 561 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 NELFEP18615 380 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXM1Q08050 763 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 VAC14Q08AM6 782 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC81Q6ZN84 652 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A15Q8IZD6 547 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCN9Q8WX39 176 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKD1Q969G9 470 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZPBPQ9BS86 351 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSSK1BQ9BXA7 367 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRMSQ9H3Y6 488 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAMD15Q9P1V8 674 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASIC3Q9UHC3 531 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNPTGQ9UJJ9 305 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 POMT2Q9UKY4 750 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7ENP7 123 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTN3A3O00478 584 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTN3A1O00481 513 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD1O60671 282 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPC4O75487 556 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFS3O75489 264 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKG2Q13237 762 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTSL3PQ5NE16 218 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 MANEAQ5SRI9 462 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRNIPQ6NTE8 343 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMC6Q6NXE6 501 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC6Q86X45 466 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 VRK3Q8IV63 474 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPGAT1Q92604 370 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPM1MQ96MI6 270 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6C1Q96RD1 312 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCND1Q9NSA2 647 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PILRAQ9UKJ1 303 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ICKQ9UPZ9 632 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASF1AQ9Y294 204 aa19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLGAP3O95886 979 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPBGLP0DKB5 382 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAMP19021 973 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 WT1P19544 449 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 OGNP20774 298 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 AOAHP28039 575 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP1A2P50993 1020 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA14Q0VDF9 509 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKAA1Q13131 559 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNAB1Q14722 419 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM135Q86UB9 458 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 KMT5CQ86Y97 462 aa18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms