RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATOH8Q96SQ7 321 aa26.82■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 H2AFJQ9BTM1 129 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52A5Q9H2C5 316 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD274Q9NZQ7 290 aa26.82■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa26.82■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTR1AP61163 376 aa26.81■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM42Q8IWZ5 723 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC12A9Q9BXP2 914 aa26.81■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC30A9Q6PML9 568 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A9Q8IVM8 553 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 C10orf107Q8IVU9 208 aa26.8■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TGFBIQ15582 683 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTC23LQ6PF05 361 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 XKR5Q6UX68 686 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC5DQ6UXZ4 953 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 RABEPKQ7Z6M1 372 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT4Q9NZJ9 180 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF15Q9UIH9 416 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GVT2 93 aa26.79■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO39Q8N4B4 442 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGEC3Q8TD91 643 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CAPS2Q9BXY5 557 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 RDH14Q9HBH5 336 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM74BQ9NUR3 256 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASF1AQ9Y294 204 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 FFAR2O15552 330 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM13O60858 407 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACADLP28330 430 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXD12P35452 270 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKAA2P54646 552 aa26.78■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GPBAR1Q8TDU6 330 aa26.78■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CKAP2Q8WWK9 683 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHF21BQ96EK2 531 aa26.78■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OXSMQ9NWU1 459 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL15Q9NXU5 204 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPASTQ9UBP0 616 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE10AQ9Y233 779 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 GON4LQ3T8J9 2241 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR19A6NJB7 356 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 IPO13O94829 963 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 GUCA1CO95843 209 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT33BQ14525 404 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELOCQ15369 112 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDK4Q16654 411 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHKG1Q16816 387 aa26.77■■□□□ 1.88
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