RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315869.7

TFE3-201, Transcript of transcription factor binding to IGHM enhancer 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TFE3, Length 3,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3-201ENST00000315869 M0QZQ0 153 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CLPXO76031 633 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 RELAQ04206 551 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CD47Q08722 323 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 GTF2H2Q13888 395 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 GPNMBQ14956 572 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ADCK1Q86TW2 530 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 EID3Q8N140 333 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 LEMD2Q8NC56 503 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 NTN4Q9HB63 628 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.64□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 INSIG1O15503 277 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ZNF12P17014 697 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CARTPTQ16568 116 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 TSSK3Q96PN8 268 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 NODALQ96S42 347 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CLPBQ9H078 707 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 MED16Q9Y2X0 877 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 WASH4PA8MWX3 477 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ALPLP05186 524 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 OPRL1P41146 370 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 BCAP31P51572 246 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CYP4F3Q08477 520 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 SPCS2Q15005 226 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 UTS2BQ765I0 119 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 BEND5Q7L4P6 421 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 LIX1Q8N485 282 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 TANKQ92844 425 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CIPCQ9C0C6 399 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 C8orf4Q9NR00 106 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ADAM12O43184 909 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 KDM1AO60341 852 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 SH3BGRLO75368 114 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 TULP3O75386 442 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 RXRGP48443 463 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 COQ5Q5HYK3 327 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 SPARTQ8N0X7 666 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 PKMYT1Q99640 499 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 GKN1Q9NS71 199 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 H0YAE9 185 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CXCR6O00574 342 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CRHBPP24387 322 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 PWP1Q13610 501 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 12.4
TFE3-201ENST00000315869 GALNT10Q86SR1 603 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 TEX26Q8N6G2 289 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 GPR150Q8NGU9 434 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CD200R1Q8TD46 325 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 TSPEARQ8WU66 669 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 RORBQ92753 470 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 RASSF1Q9NS23 344 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 E2F3O00716 465 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 STX16O14662 325 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 FKTNO75072 461 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 ULK1O75385 1050 aa14.62□□□□□ -0.07
TFE3-201ENST00000315869 FKBP9O95302 570 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms