RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049184.8

Ushbp1-201, Transcript of Usher syndrome type-1C protein-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ushbp1, Length 2,438 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Atxn1lP0C7T6 687 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 WarsP32921 481 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Cyp2c39P56656 490 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Cdh6P97326 790 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Pcgf5Q3UK78 256 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Zfp560Q3URI6 754 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Pnpla1Q3V1D5 599 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Olfr8Q60892 310 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Fstl5Q8BFR2 847 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ikzf5Q8BU00 419 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Bdh2Q8JZV9 245 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ugt2b1Q8R084 529 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Prrg2Q8R182 198 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Olfr691Q8VGW5 322 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 PdgfdQ925I7 370 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ddit4Q9D3F7 229 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tmod3Q9JHJ0 352 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm10717D3Z1I8 228 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Bard1O70445 765 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Kcnj1O88335 372 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 GzmcP08882 248 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 F2P19221 618 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Pdha2P35487 391 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tm9sf2P58021 662 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Brms1lQ3U1T3 323 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 CenplQ3U3S3 329 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Cyp2c67Q569X9 491 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Crtc1Q68ED7 630 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 VwdeQ6DFV8 926 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ubtd2Q6PGH0 234 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Naaladl1Q7M758 745 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Adam39Q7M762 756 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Pnma8aQ80VM8 430 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Galnt13Q8CF93 556 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Q8K207 121 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 GabrpQ8QZW7 440 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 DeraQ91YP3 318 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Adgre4Q91ZE5 689 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Mri1Q9CQT1 369 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tmed11Q9D2R4 215 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tcf7l1Q9Z1J1 584 aa14.56□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Shroom3Q9QXN0 1986 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Fam136b-psA0A140T8T1 138 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Mroh7A2AVR2 1279 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Esp31A8R0W3 114 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 SykP48025 629 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Emx2Q04744 253 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Fam171bQ14CH0 825 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Kcnh6Q32ME0 950 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 LchnQ3UHG7 455 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Znrf3Q5SSZ7 913 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Cln3Q61124 438 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Rtl3Q6P1Y1 553 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Olfr667Q7TRP4 326 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Rsbn1Q80T69 795 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Fmo9Q8C116 539 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Smco1Q8CEZ1 214 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ca12Q8CI85 354 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Zbtb20Q8K0L9 741 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Syt12Q920N7 421 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Q99LU8 229 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Cyp2c55Q9D816 490 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 C1qtnf3Q9ES30 246 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Pkp3Q9QY23 797 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Rgs20Q9QZB1 239 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Zfp973A2BE20 318 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Olfr543E9PWI5 336 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Zfp607bG3X9H3 648 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Clcn7O70496 803 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Rrm2P11157 390 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Acvr1P37172 509 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Sox2P48432 319 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Hhla1Q3TYV2 514 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 IspdQ5RJG7 447 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Wbp4Q61048 376 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Nr6a1Q64249 495 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 BC061212Q6P8K3 481 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Ugt2a2Q6PDD0 528 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Reps2Q80XA6 521 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tgm4Q8BZH1 670 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Sirt3Q8R104 334 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tmem161aQ8VCA6 480 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Fam20bQ8VCS3 409 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Man2c1Q91W89 1039 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 AassQ99K67 926 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Them5Q9CQJ0 248 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Pus10Q9D3U0 527 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Pdzk1Q9JIL4 519 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Tsga8Q9JJL0 238 aa14.55□□□□□ -0.08
Ushbp1-201ENSMUST00000049184 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18 ms