RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637383.1

SMARCA2-262, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5

Gene SMARCA2, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SMARCA2-262	ENST00000637383	COG4	Q9H9E3	785 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SMARCA2-262	ENST00000637383	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SMARCA2-262	ENST00000637383	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SMARCA2-262	ENST00000637383	PDE7B	Q9NP56	450 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SMARCA2-262	ENST00000637383	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SMARCA2-262	ENST00000637383	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SMARCA2-262	ENST00000637383	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SMARCA2-262	ENST00000637383	NBAS	A2RRP1	2371 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CCDC78	A2IDD5	438 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	TLCD2	A6NGC4	264 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR51F1	A6NGY5	319 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ARHGAP6	O43182	974 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRT86	O43790	486 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	SUN1	O94901	812 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	AP2A2	O94973	939 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	TIAF1	O95411	115 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	IFNB1	P01574	187 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	EBLN1	P0CF75	366 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	PDHA2	P29803	388 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	FDFT1	P37268	417 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	GRIA1	P42261	906 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CCR10	P46092	362 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CD151	P48509	253 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	POLE2	P56282	527 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	HSD11B2	P80365	405 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	MC1R	Q01726	317 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ACY1	Q03154	408 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CDC20	Q12834	499 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CDH17	Q12864	832 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	RPA4	Q13156	261 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	TUBB3	Q13509	450 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRT33B	Q14525	404 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	DBN1	Q16643	649 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CCDC38	Q502W7	563 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	OOSP2	Q86WS3	158 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	D2HGDH	Q8N465	521 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	STARD8	Q92502	1023 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	PPM1M	Q96MI6	270 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	FGF21	Q9NSA1	209 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CROT	Q9UKG9	612 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	RARRES3	Q9UL19	164 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	PADI1	Q9ULC6	663 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	SEC16A	O15027	2179 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	HEATR9	A2RTY3	570 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	MATN2	O00339	956 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	SLC28A2	O43868	658 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	MT-ND3	P03897	115 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	GSTM1	P09488	218 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ETS1	P14921	441 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	TCN2	P20062	427 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	FOXN2	P32314	431 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	DLST	P36957	453 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	NSG1	P42857	185 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	PREP	P48147	710 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	ARL4D	P49703	201 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	TUBB4B	P68371	445 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	NFKB2	Q00653	900 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	GSTM4	Q03013	218 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	PRKAA1	Q13131	559 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	KCNAB2	Q13303	367 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	SEMA5A	Q13591	1074 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SMARCA2-262	ENST00000637383	SNX1	Q13596	522 aa		7.57	□□□□□ -1.2

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