RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 HDAC8Q9BY41 377 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-210ENST00000567949 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-210ENST00000567949 NDE1Q9NXR1 346 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-210ENST00000567949 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CTU2-210ENST00000567949 GIMAP2Q9UG22 337 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-210ENST00000567949 LAMA3Q16787 3333 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 K7EPI3 171 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 TBX10O75333 385 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 SOD1P00441 154 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 C6P13671 934 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 HGFP14210 728 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 PSMD8P48556 350 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 TRAF3Q13114 568 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 STX5Q13190 355 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 TTC23LQ6PF05 361 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 ABHD8Q96I13 439 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 ARL15Q9NXU5 204 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CCDC167Q9P0B6 97 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 GFYI3L273 518 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 INPP4BO15327 924 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 MMP20O60882 483 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 SLCO2B1O94956 709 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CAPN1P07384 714 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 GPX3P22352 226 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 GDF5P43026 501 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CCNG1P51959 295 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 ACTR3P61158 418 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 ART3Q13508 389 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 METTL6Q8TCB7 284 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 RAB7BQ96AH8 199 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CDH23Q9H251 3354 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 ATG13O75143 517 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 HIST1H2ADP20671 130 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 GGT5P36269 586 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 P2RY2P41231 377 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 PRLHRP49683 370 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CTSCP53634 463 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 DPTQ07507 201 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 ENPP2Q13822 863 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 GSTA3Q16772 222 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 KIF19Q2TAC6 998 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 NPAS2Q99743 824 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 RIC8BQ9NVN3 520 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 TSPAN6O43657 245 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 STK16O75716 305 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 PDE5AO76074 875 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 MTHFRP42898 656 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 PIK3CGP48736 1102 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 MTTPP55157 894 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 PAOXQ6QHF9 649 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 NLRP8Q86W28 1048 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 KATNA1O75449 491 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 PSMG1O95456 288 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 IDO1P14902 403 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 EPB42P16452 691 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CYP2A7P20853 494 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CNTN1Q12860 1018 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 SCIMPQ6UWF3 145 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 MTSS1LQ765P7 747 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 TDHQ8IZJ6 230 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 MIER2Q8N344 545 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 OR9I1Q8NGQ6 314 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 OR2T11Q8NH01 316 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.05■□□□□ 0.8
CTU2-210ENST00000567949 STMN2Q93045 179 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms