RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ADPRH	P54922	357 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NME5	P56597	212 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GBE1	Q04446	702 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKCZ	Q05513	592 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CHIT1	Q13231	466 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GPM6B	Q13491	265 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RUNX2	Q13950	521 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CNGA3	Q16281	694 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	UGCG	Q16739	394 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MAJIN	Q3KP22	176 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	BOLA3	Q53S33	107 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	XKR9	Q5GH70	373 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NOTUM	Q6P988	496 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SYVN1	Q86TM6	617 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AACS	Q86V21	672 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KAT2B	Q92831	832 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A28	Q96A46	364 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SGF29	Q96ES7	293 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP36	Q96G28	342 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	COG3	Q96JB2	828 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMD8	Q96LT4	415 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GSDMA	Q96QA5	445 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD6	Q9BV23	337 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ECT2	Q9H8V3	914 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PKP3	Q9Y446	797 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB3	Q9Y575	518 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE4B	O95155	1302 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		F8W810	466 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		F8WDY8	70 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CXCL11	O14625	94 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEB3	O15480	346 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC14L5	O43304	696 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DIAPH2	O60879	1101 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MED24	O75448	989 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GPC4	O75487	556 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0754	O94854	1291 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLITRK3	O94933	977 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ADA	P00813	363 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP2	P08253	660 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPY4	P0CV99	314 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPY10	P0CW01	314 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXB2	P14652	356 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AREG	P15514	252 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PFKFB1	P16118	471 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PRLR	P16471	622 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RPA1	P27694	616 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFS1	P28331	727 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX6	P35712	828 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PGGT1B	P53609	377 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R40	P59535	323 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	BEX3	Q00994	111 aa		2.76	□□□□□ -1.97

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