RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC38Q502W7 563 aa24.32■■□□□ 1.48
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PTPRJ-206ENST00000534219 CLDN19Q8N6F1 224 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 OR4E2Q8NGC2 313 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 C1orf54Q8WWF1 131 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
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PTPRJ-206ENST00000534219 ACY1Q03154 408 aa24.31■■□□□ 1.48
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PTPRJ-206ENST00000534219 ETNK1Q9HBU6 452 aa24.31■■□□□ 1.48
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PTPRJ-206ENST00000534219 OR51F1A6NGY5 319 aa24.29■■□□□ 1.48
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PTPRJ-206ENST00000534219 KCNAB2Q13303 367 aa24.28■■□□□ 1.48
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PTPRJ-206ENST00000534219 CD151P48509 253 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 LAMB3Q13751 1172 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 D2HGDHQ8N465 521 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 FCRL4Q96PJ5 515 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 KCND3Q9UK17 655 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-206ENST00000534219 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-206ENST00000534219 MATN2O00339 956 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-206ENST00000534219 QSOX1O00391 747 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-206ENST00000534219 SUN1O94901 812 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-206ENST00000534219 GSTM1P09488 218 aa24.26■■□□□ 1.47
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