RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519813.1

TMPRSS4-208, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMPRSS4, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-208ENST00000519813 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 HIC2Q96JB3 615 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CNBD2Q96M20 576 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CGREF1Q99674 301 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 DPY30Q9C005 99 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 KCNH6Q9H252 994 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 PARVBQ9HBI1 364 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 OLAHQ9NV23 265 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 C1orf109Q9NX04 203 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 IRAK3Q9Y616 596 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.16□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 C7orf72A4D263 438 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 GFYI3L273 518 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZNF197O14709 1029 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CLGNO14967 610 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 PER2O15055 1255 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ANKRD28O15084 1053 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CLOCKO15516 846 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ADAM12O43184 909 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 NIPSNAP2O75323 286 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 LRG1P02750 347 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 FTH1P02794 183 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ASLP04424 464 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 RB1P06400 928 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ADH1AP07327 375 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 POU2F2P09086 479 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 PIRTP0C851 137 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CTSAP10619 480 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC2A4P14672 509 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 GGT1P19440 569 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CYP2A7P20853 494 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 WEE1P30291 646 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 HNF1BP35680 557 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CAPGP40121 348 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CSKP41240 450 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 HK3P52790 923 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 PGGT1BP53609 377 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 DIO3P55073 304 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 FOXA1P55317 472 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 UFM1P61960 85 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 MYBPC1Q00872 1141 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 GK3PQ14409 553 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 GBX1Q14549 363 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 PTPRCAPQ14761 206 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 NR6A1Q15406 480 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 IMPG1Q17R60 797 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZBED5Q49AG3 693 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CARD16Q5EG05 197 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 NRSN1Q8IZ57 195 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 SFRP1Q8N474 314 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 NATD1Q8N6N6 113 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 RNF148Q8N7C7 305 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 PAF1Q8N7H5 531 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 EXT2Q93063 718 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 BIRC7Q96CA5 298 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ITCHQ96J02 903 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAGED4Q96JG8 741 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZIC5Q96T25 663 aa7.15□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 EGFL8Q99944 293 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms