RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM96BQ9Y3D0 163 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 YIPF1Q9Y548 306 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 EID1Q9Y6B2 187 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 TGP01266 2768 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PINLYPA6NC86 204 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRCOL1A6NCL2 159 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 E7EVH7 732 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 E9PAM4 449 aa0.14□□□□□ -2.39
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RNU6-287P-201ENST00000516230 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 WISP2O76076 250 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACTL6BO94805 426 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIGNO95427 931 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 FTCDO95954 541 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGKV1D-16P01601 117 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 NR2C1P13056 603 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CKMT2P17540 419 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 HLA-FP30511 346 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PMELP40967 661 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 TSFMP43897 325 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRIM2P49643 509 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MMP15P51511 669 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP0.14□□□□□ -2.39
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RNU6-287P-201ENST00000516230 RPS18P62269 152 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRC63Q05C16 580 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MS4A18Q3C1V0 323 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 DCAF10Q5QP82 559 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CBWD5Q5RIA9 395 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 NOTUMQ6P988 496 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 C17orf99Q6UX52 265 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SYT13Q7L8C5 426 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPAT4Q86UL3 456 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SCAMP5Q8TAC9 235 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 C11orf45Q8TAV5 145 aa0.14□□□□□ -2.39
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RNU6-287P-201ENST00000516230 SMPDL3BQ92485 455 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
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RNU6-287P-201ENST00000516230 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 BBS4Q96RK4 519 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 FNBP1Q96RU3 617 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIP5K1AQ99755 562 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 APOL2Q9BQE5 337 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCSER1Q9C0I3 900 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 OLFML3Q9NRN5 406 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 DACT1Q9NYF0 836 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SUFUQ9UMX1 484 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa0.13□□□□□ -2.39
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RNU6-287P-201ENST00000516230 NCK2O43639 380 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 GJB3O75712 270 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 DFFBO76075 338 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGHEP01854 428 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 TFP02787 698 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM200BP0CF97 657 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANPEPP15144 967 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CD1EP15812 388 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 EDN2P20800 178 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CA6P23280 308 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSPA7P48741 367 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 WNT4P56705 351 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRKCZQ05513 592 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRM3Q14832 879 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PPP2R5BQ15173 497 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB6CQ53S08 254 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CES4AQ5XG92 561 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 DENND1BQ6P3S1 775 aa0.13□□□□□ -2.39
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