RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 PTPN4P29074 926 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PRLHRP49683 370 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 MLLT10P55197 1068 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PRKAA1Q13131 559 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 GPS2Q13227 327 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SPARCL1Q14515 664 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 UGT8Q16880 541 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SARM1Q6SZW1 724 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SYVN1Q86TM6 617 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 NXPE1Q8N323 547 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 HM13Q8TCT9 377 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SEC14L1Q92503 715 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SPATA13Q96N96 652 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 COPS8Q99627 209 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 TLR10Q9BXR5 811 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 BTRCQ9Y297 605 aa16.47■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CFAP99D6REC4 459 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ITGALP20701 1170 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CDH3P22223 829 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PTPN7P35236 360 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 IL10RAQ13651 578 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 LAMB3Q13751 1172 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.46■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 AADACL2Q6P093 401 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 MICALCLQ6ZW33 695 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SNX20Q7Z614 316 aa16.46■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 OR8K5Q8NH50 307 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 THAP4Q8WY91 577 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 MIB2Q96AX9 1013 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 TBL1YQ9BQ87 522 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 CHST8Q9H2A9 424 aa16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 SRMSQ9H3Y6 488 aa16.46■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.46■□□□□ 0.23
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HERC3-211ENST00000513325 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 LDB2O43679 373 aa16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 MC4RP32245 332 aa16.45■□□□□ 0.22
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HERC3-211ENST00000513325 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 LCN9Q8WX39 176 aa16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 NRTNQ99748 197 aa16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 C19orf43Q9BQ61 176 aa16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 OR52A5Q9H2C5 316 aa16.45■□□□□ 0.22
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HERC3-211ENST00000513325 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.45■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 GSAPA4D1B5 854 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 SOWAHDA6NJG2 315 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 ARGFXA6NJG6 315 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 MEN1O00255 615 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 BTN3A3O00478 584 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 TJP3O95049 919 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 RWDD2BP57060 319 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 GPR33Q49SQ1 333 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 LCN10Q6JVE6 187 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 ALG3Q92685 438 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
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HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.44■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 PTPN13Q12923 2485 aa16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 MATN2O00339 956 aa16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 PRSS56P0CW18 603 aa16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 TPH1P17752 444 aa16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 PDHA2P29803 388 aa16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 CETN2P41208 172 aa16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 PREPP48147 710 aa16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 CD97P48960 835 aa16.43■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 CCL11P51671 97 aa16.43■□□□□ 0.22
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