RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498801.5

GARNL3-222, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, human

TSL 4

Gene GARNL3, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GARNL3-222	ENST00000498801	ZNF292	O60281	2723 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801		A0A1W2PQ67	120 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	VSTM5	A8MXK1	200 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801		E7EVH7	732 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	MID1	O15344	667 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	PSMD3	O43242	534 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	RAD51C	O43502	376 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	PGLS	O95336	258 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	MED14OS	P0DP75	135 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ACADM	P11310	421 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	CCR5	P51681	352 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	METAP1	P53582	386 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	SLC16A1	P53985	500 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	WNT3A	P56704	352 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	NRG3	P56975	720 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	TAS2R38	P59533	333 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	CDK18	Q07002	472 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	SEMA5A	Q13591	1074 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	SSPN	Q14714	243 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	KCTD11	Q693B1	232 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	C8orf74	Q6P047	294 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	TRIM69	Q86WT6	500 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	IPMK	Q8NFU5	416 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	GANC	Q8TET4	914 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	RUBCN	Q92622	972 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	RAB7B	Q96AH8	199 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ARRDC3	Q96B67	414 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	LRRC45	Q96CN5	670 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	FEM1C	Q96JP0	617 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	TRIB3	Q96RU7	358 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	CD93	Q9NPY3	652 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	SCOC	Q9UIL1	159 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	CHKB	Q9Y259	395 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	PLK4	O00444	970 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	AREL1	O15033	823 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	SUN1	O94901	812 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	SEMA4F	O95754	770 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	AP2A1	O95782	977 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	NDST3	O95803	873 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	AGT	P01019	485 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	EPO	P01588	193 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	IGHV4-34	P06331	123 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	APRT	P07741	180 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	PDHA1	P08559	390 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ADRB3	P13945	408 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	PI3	P19957	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ACSL1	P33121	698 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	ADRA1A	P35348	466 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	MAGEA6	P43360	314 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	LMAN1	P49257	510 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	NEK3	P51956	506 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	TERF1	P54274	439 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	MGAT5	Q09328	741 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	CNTN1	Q12860	1018 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	GALNT3	Q14435	633 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	SPARCL1	Q14515	664 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	CSRP2	Q16527	193 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	UGP2	Q16851	508 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GARNL3-222	ENST00000498801	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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