RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC22A3	O75751	556 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	APOA4	P06727	396 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	MSH3	P20585	1137 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	PSMC4	P43686	418 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TSPY1	Q01534	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A0B4J293	547 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CSPG5	O95196	566 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	PAX1	P15863	534 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CKMT2	P17540	419 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CBL	P22681	906 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	MFAP5	Q13361	173 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ANO5	Q75V66	913 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A087WYN8	130 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	UBE2C	O00762	179 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	PSMD10	O75832	226 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	PRSS1	P07477	247 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	GABRA5	P31644	462 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	DCT	P40126	519 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	NR2C2	P49116	596 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	THOP1	P52888	689 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CDK3	Q00526	305 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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