RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511		F5H423	210 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KMO	O15229	486 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FANCG	O15287	622 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SCRG1	O75711	98 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC4A1	P02730	911 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	EBLN1	P0CF75	366 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FOLR1	P15328	257 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	VCL	P18206	1134 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	IDS	P22304	550 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	HAL	P42357	657 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCNKA	P51800	687 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RRAD	P55042	308 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	DSC2	Q02487	901 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCL1	Q15111	1095 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC34A3	Q8N130	599 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8NA96	180 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KCT2	Q8NC54	265 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT9	Q9BW91	350 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	WIPF3	A6NGB9	483 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR89B	P0CG08	455 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP1A3	P13637	1013 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FER	P16591	822 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF165	P49910	485 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2H	P62256	183 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT81	Q14533	505 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT31	Q15323	416 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SGSM3	Q96HU1	749 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR24	Q96S15	920 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST8	Q9H2A9	424 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MTX2	O75431	263 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK14	O94921	469 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MED26	O95402	600 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CBX6	O95503	412 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ALPP	P05187	535 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	IL4R	P24394	825 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	VAV2	P52735	878 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA1	P56199	1179 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PER3	P56645	1201 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GSDMD	P57764	484 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1CA	P62136	330 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD11B2	P80365	405 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2H3	Q13889	308 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	DPYSL2	Q16555	572 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	BOLA3	Q53S33	107 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MED25	Q71SY5	747 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	HDX	Q7Z353	690 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	KMT5C	Q86Y97	462 aa		10.58	□□□□□ -0.72

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