RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 MLKLQ8NB16 471 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 GPR26Q8NDV2 337 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ZFPM2Q8WW38 1151 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 NACC2Q96BF6 587 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PPM1MQ96MI6 270 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CSPG4P5Q96PW8 444 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PCDHB18PQ96TA0 734 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 LHPPQ9H008 270 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 GANQ9H2C0 597 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SRMSQ9H3Y6 488 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 AMACRQ9UHK6 382 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ABCA4P78363 2273 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MATN3O15232 486 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ALOX12BO75342 701 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PMPCBO75439 489 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 POP7O75817 140 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CLDN14O95500 239 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PRLP01236 227 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CRYABP02511 175 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CCDC172P0C7W6 258 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PIRTP0C851 137 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MYBL2P10244 700 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MMP11P24347 488 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 AKT1P31749 480 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CD86P42081 329 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 JAM2P57087 298 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 KRTAP10-9P60411 292 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 DMPKQ09013 629 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MFAP5Q13361 173 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MAMLD1Q13495 774 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 NFE2L1Q14494 772 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 KRT81Q14533 505 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 LONRF2Q1L5Z9 754 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 BOLA3Q53S33 107 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ACAD10Q6JQN1 1059 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CCDC70Q6NSX1 233 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 RHBDD2Q6NTF9 364 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 OR4E2Q8NGC2 313 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 LCN9Q8WX39 176 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MAGED4Q96JG8 741 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 VPS35Q96QK1 796 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 NDC1Q9BTX1 674 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 DEF6Q9H4E7 631 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 GPAMQ9HCL2 828 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 DTLQ9NZJ0 730 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SEC14L3Q9UDX4 400 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SLC24A2Q9UI40 661 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CDYLQ9Y232 598 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ZNF711Q9Y462 761 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CACNA1CQ13936 2221 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CCDC78A2IDD5 438 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 KLHL33A6NCF5 533 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 OR2AG2A6NM03 316 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 TMCO5BA8MYB1 307 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 C2orf74A8MZ97 194 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MFSD11O43934 449 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SLC19A2O60779 497 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 RASAL1O95294 804 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 HLA-DQB2P05538 268 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CBSLP0DN79 551 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PYGMP11217 842 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ST6GAL1P15907 406 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MX2P20592 715 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ITGAXP20702 1163 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CBSP35520 551 aa5.95□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PCK1P35558 622 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms