RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 FBXO36Q8NEA4 188 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FBXO25Q8TCJ0 367 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PYROXD1Q8WU10 500 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 NAT14Q8WUY8 206 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 LPGAT1Q92604 370 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CERS2Q96G23 380 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PANX3Q96QZ0 392 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SLC38A3Q99624 504 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RAB33BQ9H082 229 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 WWP1Q9H0M0 922 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 OR52A5Q9H2C5 316 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 DPH5Q9H2P9 285 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 COG4Q9H9E3 785 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FAM114A2Q9NRY5 505 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PDP2Q9P2J9 529 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FBXO5Q9UKT4 447 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CDYLQ9Y232 598 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CFAP54Q96N23 3096 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PI4KAP42356 2102 aa5.26□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 OR52A4PA6NMU1 304 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 IQCF5A8MTL0 148 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PDZK1P1A8MUH7 402 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 BANF1O75531 89 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 HAUS5O94927 633 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CPNE6O95741 557 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 AHSGP02765 367 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 APOA4P06727 396 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SLC35G4P0C7Q5 338 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ERVK-10P10266 1014 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SPINK2P20155 84 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CD9P21926 228 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GABRB3P28472 473 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ALDH4A1P30038 563 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CCKBRP32239 447 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SLC1A2P43004 574 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PDX1P52945 283 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PLTPP55058 493 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GUCY2DQ02846 1103 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CFHR1Q03591 330 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CTBP1Q13363 440 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 BIRC2Q13490 618 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SPIDRQ14159 915 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 GBX1Q14549 363 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RTP5Q14D33 572 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ISXQ2M1V0 245 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC157Q569K6 752 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM71Q6P5X7 295 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 CNSTQ6PJW8 725 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM26Q6ZUK4 368 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PIM3Q86V86 326 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 KCNMB4Q86W47 210 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SLC26A11Q86WA9 606 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 DENND6AQ8IWF6 608 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 PALM2Q8IXS6 379 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D21Q8IYX1 336 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 SLC22A15Q8IZD6 547 aa5.25□□□□□ -1.57
SRPRB-205ENST00000494297 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms