RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 TGM7Q96PF1 710 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 RNF14Q9UBS8 474 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SNX24Q9Y343 169 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SDK2Q58EX2 2172 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 KRT87PA6NCN2 255 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 PRAMEF10O60809 474 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 NIPSNAP2O75323 286 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 GPC4O75487 556 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 S1PR4O95977 384 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 OR56A5P0C7T3 313 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 FMO4P31512 558 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC5A2P31639 672 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CAPZBP47756 277 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 MAPK10P53779 464 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 PRKG2Q13237 762 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CTBP1Q13363 440 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 NEPROQ6NW34 567 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 C19orf48Q6RUI8 117 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CLEC14AQ86T13 490 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 HOOK3Q86VS8 718 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 OR5AR1Q8NGP9 310 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 FGF11Q92914 225 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 USP7Q93009 1102 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 C9orf72Q96LT7 481 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC30A3Q99726 388 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CARD6Q9BX69 1037 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 STRADBQ9C0K7 418 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 APMAPQ9HDC9 416 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CRYL1Q9Y2S2 319 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 MED16Q9Y2X0 877 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 USP1O94782 785 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 AMD1P17707 334 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 AOAHP28039 575 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 TTPAP49638 278 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 TGIF1Q15583 401 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 BBS9Q3SYG4 887 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 PDZD3Q86UT5 571 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 OTUD6BQ8N6M0 293 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 FERD3LQ96RJ6 166 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 DPH5Q9H2P9 285 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 XKR8Q9H6D3 395 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM169AQ9Y6X4 670 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 MAGEB16A2A368 324 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 KLHL33A6NCF5 533 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 EFCAB7A8K855 629 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 EFCAB8A8MWE9 144 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 BTN3A3O00478 584 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 NDUFS3O75489 264 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 FTH1P02794 183 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 ITGA2BP08514 1039 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 JMJD7P0C870 316 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 ERVK-10P10266 1014 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 GABRB3P28472 473 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 ELK3P41970 407 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC1A2P43004 574 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SEPHS1P49903 392 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 SH3BP2P78314 561 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 MPP1Q00013 466 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 HSPA14Q0VDF9 509 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 RPA4Q13156 261 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms