RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SLC22A12Q96S37 553 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 FERMT1Q9BQL6 677 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 LRMDAQ9H2I8 198 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 GDE1Q9NZC3 331 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ANAPC2Q9UJX6 822 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF541Q9H0D2 1346 aa4.8□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 DESP17661 470 aa4.8□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 EXOC4Q96A65 974 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 DUX5Q96PT3 197 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 NEK1Q96PY6 1258 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SYT17Q9BSW7 474 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 FSD1Q9BTV5 496 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 OR2M5A3KFT3 312 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 OR5K3A6NET4 321 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 C15orf62A8K5M9 175 aa4.79□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 CCDC158Q5M9N0 1113 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.79□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 TEX9Q8N6V9 391 aa4.79□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 KRT35Q92764 455 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ATP6V0A1Q93050 837 aa4.79□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 CFAP57Q96MR6 1250 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 NEURL2Q9BR09 285 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 EBF2Q9HAK2 575 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.79□□□□□ -1.64
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