RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468284.1

CKAP2-205, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene CKAP2, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-205ENST00000468284 SFRP1Q8N474 314 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 NUDT11Q96G61 164 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 C1orf74Q96LT6 269 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 TBCBQ99426 244 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 JAM3Q9BX67 310 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 TEX101Q9BY14 249 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 VPS11Q9H270 941 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 DLL4Q9NR61 685 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 OGFRQ9NZT2 677 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ADAM29Q9UKF5 820 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.76□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 SVILO95425 2214 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 C21orf140B9A014 251 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 C19orf84I3L1E1 186 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 BUB1O43683 1085 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 KDELR3O43731 214 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 CUTAO60888 179 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 DAB1O75553 588 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 COX6B1P14854 86 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 HTR1EP28566 365 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ETFBP38117 255 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 HMGA2P52926 109 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 HDAC4P56524 1084 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 RHOAP61586 193 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 PPP2R2AP63151 447 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 CDK3Q00526 305 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 DEUP1Q05D60 604 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ART3Q13508 389 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 PTPRRQ15256 657 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 LLGL1Q15334 1064 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 LCN10Q6JVE6 187 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 TRNP1Q6NT89 227 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ERAP2Q6P179 960 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 SYVN1Q86TM6 617 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 DTX3Q8N9I9 347 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 LMO3Q8TAP4 145 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 C9orf72Q96LT7 481 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 NT5C1BQ96P26 610 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 TGM7Q96PF1 710 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF747Q9BV97 191 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 GPR83Q9NYM4 423 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 LHX3Q9UBR4 397 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.75□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 A0A0U1RQS6 177 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 FAM72CH0Y354 149 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 CYR61O00622 381 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 THAP12O43422 761 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 STX10O60499 249 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 IGSF6O95976 241 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ANKRD34CP0C6C1 535 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 FGF5P12034 268 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 CD99P14209 185 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 TYRP1P17643 537 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 RGRP47804 291 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 RAD51Q06609 339 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 MTA1Q13330 715 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 KCNAB1Q14722 419 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ACOX1Q15067 660 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 TRIM74Q86UV6 250 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 NLRP14Q86W24 1093 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 FAM72BQ86X60 149 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 NXPE1Q8N323 547 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 SLC35C1Q96A29 364 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 NEU3Q9UQ49 428 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.74□□□□□ -1.01
CKAP2-205ENST00000468284 RASA4BC9J798 803 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms