RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GSTM1P09488 218 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NDUFS1P28331 727 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRAMEP78395 509 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRADDP78560 199 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GSTM4Q03013 218 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPA4Q13156 261 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCID2Q5JVF3 399 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTC27Q6P3X3 843 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OOSP2Q86WS3 158 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC35F6Q8N357 371 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RASGEF1CQ8N431 466 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL22RA1Q8N6P7 574 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PBKQ96KB5 322 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR6C1Q96RD1 312 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FERD3LQ96RJ6 166 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP3K3Q99759 626 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KALRNO60229 2985 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TK2O00142 265 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 QSOX1O00391 747 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR1I1O60431 355 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FTH1P02794 183 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRB1P04280 392 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD151P48509 253 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VPS41P49754 854 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TERF1P54274 439 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEMA3AQ14563 771 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CERS6Q6ZMG9 384 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NLGN4XQ8N0W4 816 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ELMO1Q92556 727 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBXN4Q92575 508 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF31Q96EP0 1072 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SGSM3Q96HU1 749 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ELMO2Q96JJ3 720 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC41A2Q96JW4 573 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD180Q99467 661 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTC1Q99614 292 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AP1M1Q9BXS5 423 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TLCD2A6NGC4 264 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AP3B1O00203 1094 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZSCAN12O43309 604 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DLGAP3O95886 979 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR56A5P0C7T3 313 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LIFP15018 202 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF28P17035 718 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TPSB2P20231 275 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MGAT1P26572 445 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPY2RP49146 381 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL11RAQ14626 422 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNAB1Q14722 419 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRD3Q15059 726 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TPSAB1Q15661 275 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARMC6Q6NXE6 501 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PHC3Q8NDX5 983 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LCN9Q8WX39 176 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WBP1Q96G27 269 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NRTNQ99748 197 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL22Q9GZX6 179 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TREX1Q9NSU2 369 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BFARQ9NZS9 450 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.14■□□□□ 0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRT14P02533 472 aa15.14■□□□□ 0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOLR1P15328 257 aa15.14■□□□□ 0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NMBRP28336 390 aa15.14■□□□□ 0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms