RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 NXPE1Q8N323 547 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 D2HGDHQ8N465 521 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 OR4E2Q8NGC2 313 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFPM2Q8WW38 1151 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 MR1Q95460 341 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TBL1YQ9BQ87 522 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 FERMT1Q9BQL6 677 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TLR10Q9BXR5 811 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SOHLH2Q9NX45 425 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 DUSP10Q9Y6W6 482 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC66A2RUB6 948 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL33A6NCF5 533 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SCRG1O75711 98 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PDGFAP04085 211 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PYGMP11217 842 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGALP20701 1170 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN4P29074 926 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 MLLT10P55197 1068 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS15P62841 145 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PDE1BQ01064 536 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 GPS2Q13227 327 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 IL10RAQ13651 578 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TMTC4Q5T4D3 741 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 DENND5AQ6IQ26 1287 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TCTN3Q6NUS6 607 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SARM1Q6SZW1 724 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SNX20Q7Z614 316 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TEX19Q8NA77 164 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC38A9Q8NBW4 561 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 LCN9Q8WX39 176 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ALG3Q92685 438 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ULK4Q96C45 1275 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA13Q96N96 652 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 COPS8Q99627 209 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 NRTNQ99748 197 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR87Q9BY21 358 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM55Q9BYV6 548 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CHST8Q9H2A9 424 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 KCND1Q9NSA2 647 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 POMT2Q9UKY4 750 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 BTRCQ9Y297 605 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 GSAPA4D1B5 854 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 ARGFXA6NJG6 315 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 AGAP14A8MT82 685 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP99D6REC4 459 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 LDB2O43679 373 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 RECKO95980 971 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 PRSS56P0CW18 603 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 TPH1P17752 444 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 CDH3P22223 829 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 NDUFS1P28331 727 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 MC4RP32245 332 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN7P35236 360 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 PRLHRP49683 370 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 RWDD2BP57060 319 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 CHAF1BQ13112 559 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 PRKAA1Q13131 559 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 SEMA5AQ13591 1074 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 UGT8Q16880 541 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 CPZQ66K79 652 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 LCN10Q6JVE6 187 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 PHC3Q8NDX5 983 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 ACVR1CQ8NER5 493 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 OR8K5Q8NH50 307 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 HM13Q8TCT9 377 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 MIB2Q96AX9 1013 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 FERD3LQ96RJ6 166 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 CCM2Q9BSQ5 444 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 LACRTQ9GZZ8 138 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL25Q9H0H3 589 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 SRMSQ9H3Y6 488 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 COG4Q9H9E3 785 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKMY1Q9P2S6 941 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 EFR3BQ9Y2G0 817 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms