RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 E7EVH7 732 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CCDC188H7C350 402 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PHF2O75151 1096 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 MTX2O75431 263 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 METTL18O95568 372 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 EML2O95834 649 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 EPOP01588 193 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 HMGCLP35914 325 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 SPAM1P38567 509 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CAPZBP47756 277 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 SEPHS1P49903 392 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 DCDC1P59894 354 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TMPRSS15P98073 1019 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PTPRCAPQ14761 206 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 INSCQ1MX18 579 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PARP6Q2NL67 630 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 P3H1Q32P28 736 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CRTC3Q6UUV7 619 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TTC30BQ8N4P2 665 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TRAM1L1Q8N609 369 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PRELID2Q8N945 189 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A23Q9BV35 468 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 LHX9Q9NQ69 397 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 KLC4Q9NSK0 619 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 RARRES3Q9UL19 164 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ARL5AQ9Y689 179 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 C2orf81A6NN90 581 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 KMOO15229 486 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 GPR39O43194 453 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 SPAG6O75602 509 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ETS1P14921 441 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TPH1P17752 444 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 GNLYP22749 145 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 F8A1P23610 371 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 HALP42357 657 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 UQCRFS1P47985 274 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ARL4DP49703 201 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 GFERP55789 205 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ACY1Q03154 408 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 GTF2H3Q13889 308 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TEX35Q5T0J7 233 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CACHD1Q5VU97 1274 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 SYVN1Q86TM6 617 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 UBXN4Q92575 508 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 GLYATL1Q969I3 302 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CXorf40BQ96DE9 158 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 KRT12Q99456 494 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TIMM29Q9BSF4 260 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 RAB33BQ9H082 229 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ACSS2Q9NR19 701 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ATXN10Q9UBB4 475 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ITPR2Q14571 2701 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ESPL1Q14674 2120 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CCDC78A2IDD5 438 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 VEGFDO43915 354 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 UGT1A9O60656 530 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 DPM1O60762 260 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 KCNJ13O60928 360 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CRTAMO95727 393 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ZNF28P17035 718 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TYRP1P17643 537 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 NELFEP18615 380 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 UGT1A6P19224 532 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 LPOP22079 712 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 IDSP22304 550 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 UGT1A1P22309 533 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 UGT1A4P22310 534 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 AKT1P31749 480 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ADRA1AP35348 466 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 KCNJ1P48048 391 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TERF1P54274 439 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TUBB3Q13509 450 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CHRNA6Q15825 494 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CCNG2Q16589 344 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CYP1B1Q16678 543 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 UGT8Q16880 541 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms