RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434561.1

TP53BP1-208, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 3

Gene TP53BP1, Length 613 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-208	ENST00000434561	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	VPS18	Q9P253	973 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	NBAS	A2RRP1	2371 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	C9orf172	C9J069	976 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	B4GAT1	O43505	415 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ATP8B1	O43520	1251 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	VAPB	O95292	243 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	PRAMEF1	O95521	474 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPR89B	P0CG08	455 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	SPTB	P11277	2137 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	GABRB3	P28472	473 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ALDH4A1	P30038	563 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	POLD2	P49005	469 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	B4GALNT1	Q00973	533 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	KCNC4	Q03721	635 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	PTPRCAP	Q14761	206 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	COLEC12	Q5KU26	742 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	MANEA	Q5SRI9	462 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CASC4	Q6P4E1	433 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	DOK6	Q6PKX4	331 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	SPRED1	Q7Z699	444 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CCDC25	Q86WR0	208 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	LRRC6	Q86X45	466 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	PALM2	Q8IXS6	379 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	NXPE1	Q8N323	547 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	FBF1	Q8TES7	1133 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ULK4	Q96C45	1275 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	NUS1	Q96E22	293 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	SGF29	Q96ES7	293 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	TMEM74	Q96NL1	305 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	FAM117A	Q9C073	453 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	P2RY12	Q9H244	342 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CLMP	Q9H6B4	373 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CD84	Q9UIB8	345 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	MED13	Q9UHV7	2174 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	PRSS38	A1L453	326 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	HMX2	A2RU54	273 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	PRR19	A6NJB7	356 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	SGTA	O43765	313 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	WISP1	O95388	367 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ACSL3	O95573	720 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	S1PR4	O95977	384 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	LIPC	P11150	499 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	GLB1	P16278	677 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ITGAL	P20701	1170 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ACRV1	P26436	265 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CCKBR	P32239	447 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	MC4R	P32245	332 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CA5A	P35218	305 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	MAGEA12	P43365	314 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	GNPDA1	P46926	289 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	TTPA	P49638	278 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	KIAA1024L	P59773	190 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	PRAME	P78395	509 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	SEPT6	Q14141	434 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	SEMA3A	Q14563	771 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CASP8	Q14790	479 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	CHRNA6	Q15825	494 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	ALS2CL	Q60I27	953 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TP53BP1-208	ENST00000434561	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		9.17	□□□□□ -0.94

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