RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 CXorf40BQ96DE9 158 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 COPS8Q99627 209 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 STRADBQ9C0K7 418 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TSPYL1Q9H0U9 437 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PRORYQ9H606 182 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 WHRNQ9P202 907 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PLAGL1Q9UM63 463 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa10□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TTI1O43156 1089 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PPFIA2O75334 1257 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 UBXN7O94888 489 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TIAF1O95411 115 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 POLBP06746 335 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 RHOXF2BP0C7M4 288 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 SPTBP11277 2137 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF28P17035 718 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PSMA3P25788 255 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 EPHA4P54764 986 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 GPLD1P80108 840 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ACVR1Q04771 509 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 CACNG1Q06432 222 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 GPS1Q13098 491 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PLCL1Q15111 1095 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 IRGCQ6NXR0 463 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PCGF5Q86SE9 256 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TRIM73Q86UV7 250 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 VRK3Q8IV63 474 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 OR2L2Q8NH16 312 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 CPT1BQ92523 772 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 MFSD3Q96ES6 412 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ELMO2Q96JJ3 720 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TTC25Q96NG3 672 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 RANBP9Q96S59 729 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TREX1Q9NSU2 369 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 RELNP78509 3460 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 HEATR9A2RTY3 570 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 MGAT4DA6NG13 374 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 EFSO43281 561 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ATP8B1O43520 1251 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ERLIN1O75477 346 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 KRT14P02533 472 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 C9P02748 559 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 SLC2A4P14672 509 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TPSB2P20231 275 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 IDSP22304 550 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 HADHAP40939 763 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 MAGEA6P43360 314 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 SLC7A5Q01650 507 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 GUCY2DQ02846 1103 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TPSAB1Q15661 275 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 FAM136AQ96C01 138 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 LRRC45Q96CN5 670 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 C9orf72Q96LT7 481 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PWWP2AQ96N64 755 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 CMKLR1Q99788 373 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 KLHL25Q9H0H3 589 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 XKR8Q9H6D3 395 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 HGSO14964 777 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-216ENST00000428482 TP73O15350 636 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms