RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415017.1

CNN3-203, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-203ENST00000415017 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa13.01□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 A0A1B0GTQ1 180 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 GOLGA6L10A6NI86 522 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PATE3B3GLJ2 98 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PROB1E7EW31 1015 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PIAS2O75928 621 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 SBK3P0C264 359 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 CCDC166P0CW27 439 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ACP5P13686 325 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 VCLP18206 1134 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 SAT1P21673 171 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ATP6V0D1P61421 351 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 HSPA14Q0VDF9 509 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 GRIK2Q13002 908 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PPP1R3AQ16821 1122 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ZNF542PQ5EBM4 170 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 LVRNQ6Q4G3 990 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 NAPRTQ6XQN6 538 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ISCA2Q86U28 154 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PDZD3Q86UT5 571 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 RHEBL1Q8TAI7 183 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 DENND1AQ8TEH3 1009 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 KCTD4Q8WVF5 259 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ASB11Q8WXH4 323 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 TWSG1Q9GZX9 223 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 DNAJC28Q9NX36 388 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 TBC1D29Q9UFV1 150 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 DCDC2Q9UHG0 476 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 TLK1Q9UKI8 766 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 EMCNQ9ULC0 261 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 GPSM3Q9Y4H4 160 aa13□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 LMO7DNF2Z398 122 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ARHGAP33O14559 1287 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 SLC16A5O15375 505 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 EML2O95834 649 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ZNF806P0C7X5 589 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 IDSP22304 550 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 AK4P27144 223 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 MAPK9P45984 424 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PREPP48147 710 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 KCNC1P48547 511 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 RGS4P49798 205 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.339e-7■■□□□ 13.1
CNN3-203ENST00000415017 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 MPP2Q14168 576 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ACAP2Q15057 778 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 LPAL2Q16609 132 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 UAP1L1Q3KQV9 507 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 OGFOD3Q6PK18 319 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 IL27RAQ6UWB1 636 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 SBSNQ6UWP8 590 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 DBX2Q6ZNG2 339 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 RAPH1Q70E73 1250 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 C4orf33Q8N1A6 199 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 SLC25A45Q8N413 288 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 DLG3Q92796 817 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 KIAA1191Q96A73 305 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 TMEM159Q96B96 161 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PTERQ96BW5 349 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 NXNL1Q96CM4 212 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 LINGO1Q96FE5 620 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 APOPT1Q96IL0 206 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 RMDN2Q96LZ7 410 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ATOH8Q96SQ7 321 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 GSDMCQ9BYG8 508 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 SLC13A1Q9BZW2 595 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 VPS11Q9H270 941 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 PCMTD2Q9NV79 361 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 ZNF358Q9NW07 568 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 TMEM216Q9P0N5 145 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 SPASTQ9UBP0 616 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 MOSPD1Q9UJG1 213 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 KCNK6Q9Y257 313 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 WDR37Q9Y2I8 494 aa12.99□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 H3BM21 787 aa12.98□□□□□ -0.33
CNN3-203ENST00000415017 H3BQF6 201 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms