RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401596.1

CNN3P1-201, Transcript of calponin 3 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CNN3P1, Length 935 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3P1-201ENST00000401596 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 CCNYL1Q8N7R7 359 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 DLG3Q92796 817 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 RILPQ96NA2 401 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 NECTIN4Q96NY8 510 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 NUF2Q9BZD4 464 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ZMYND15Q9H091 742 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 CD248Q9HCU0 757 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ACSS2Q9NR19 701 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ARMCX1Q9P291 453 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF225Q9UK10 706 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.26□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 IGF2RP11717 2491 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 TMEM233B4DJY2 109 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 C10orf142B7Z368 130 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 K7EQS6 105 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 PPP6CO00743 305 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 WNT9AO14904 365 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 AZIN1O14977 448 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 RAD51BO15315 384 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 FFAR2O15552 330 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 DIAPH2O60879 1101 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 SUPT3HO75486 399 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ESRRBO95718 433 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 MLYCDO95822 493 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 APODP05090 189 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ADRB1P08588 477 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 GSTM1P09488 218 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 HLA-EP13747 358 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ADRB3P13945 408 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ETV3P41162 512 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 PRLHRP49683 370 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 RAP1GDS1P52306 607 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 METAP1P53582 386 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 PKNOX1P55347 436 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 GSTM4Q03013 218 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 KDSRQ06136 332 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 PCDH1Q08174 1060 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 GRM2Q14416 872 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 BCL7AQ4VC05 210 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 XKR7Q5GH72 579 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 OGFOD2Q6N063 350 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 RINLQ6ZS11 566 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ACAD11Q709F0 780 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 YAF2Q8IY57 180 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF366Q8N895 744 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 SCAMP4Q969E2 229 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 GLYATL1Q969I3 302 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 PPP1R16AQ96I34 528 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF382Q96SR6 550 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 CCT7Q99832 543 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 GABRG3Q99928 467 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 KXD1Q9BQD3 176 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 APOL5Q9BWW9 433 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 TUBB1Q9H4B7 451 aa7.25□□□□□ -1.25
CNN3P1-201ENST00000401596 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms