RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ADCK1Q86TW2 530 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SPARTQ8N0X7 666 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC4FQ8N1N0 589 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TNIP3Q96KP6 325 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 C8orf48Q96LL4 319 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TEKT5Q96M29 485 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LHPPQ9H008 270 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 COMMD8Q9NX08 183 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PADI3Q9ULW8 664 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ILVBLA1L0T0 632 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 A8MT66 165 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 EVPLLA8MZ36 301 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CACNG3O60359 315 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM11O75078 769 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RECQL4O94761 1208 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MYO1DO94832 1006 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CHEK2O96017 543 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CKBP12277 381 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A2P23975 617 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PNPLA4P41247 253 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ARL4DP49703 201 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RAD23AP54725 363 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GEMP55040 296 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DEFA1P59665 94 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DEFA3P59666 94 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CXCR4P61073 352 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HERVK_113P63132 956 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ECT2LQ008S8 904 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNB3Q05901 458 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SELPLGQ14242 412 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 XKR4Q5GH76 650 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 UBXN11Q5T124 520 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CNSTQ6PJW8 725 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LAYNQ6UX15 382 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LGI2Q8N0V4 545 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CADM3Q8N126 398 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SCML4Q8N228 414 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HEXDCQ8WVB3 486 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RORBQ92753 470 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 WNT8BQ93098 351 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NT5C3BQ969T7 300 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF560Q96MR9 790 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MUS81Q96NY9 551 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TSGA13Q96PP4 275 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NODALQ96S42 347 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 USE1Q9NZ43 259 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 IPPQ9Y573 584 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TRIP11Q15643 1979 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC154A6NI56 674 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SYCE1LA8MT33 242 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 TPST1O60507 370 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFS2O75306 463 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SNAP29O95721 258 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms