RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 ING5Q8WYH8 240 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 DNASE1L2Q92874 299 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 SMARCD2Q92925 531 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 ELSPBP1Q96BH3 223 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 BICD1Q96G01 975 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 GPR88Q9GZN0 384 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 POLD4Q9HCU8 107 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 PTPRHQ9HD43 1115 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 ASAH2Q9NR71 780 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 ARL15Q9NXU5 204 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 RAB23Q9ULC3 237 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 CITO14578 2027 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 I3L4J1 428 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-204ENST00000367379 SLC16A4O15374 487 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 BUB3O43684 328 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 FGF19O95750 216 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 EDN1P05305 212 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-204ENST00000367379 CYP3A5P20815 502 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 UBA7P41226 1012 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 TMPRSS3P57727 454 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-204ENST00000367379 HYIQ5T013 277 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 ARMCX5Q6P1M9 558 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 DSTYKQ6XUX3 929 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-204ENST00000367379 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-204ENST00000367379 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-204ENST00000367379 SEC24AO95486 1093 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-204ENST00000367379 TYMPP19971 482 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-204ENST00000367379 ARHGAP8P85298 464 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 ST3GAL1Q11201 340 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 TWF1Q12792 350 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 GPR17Q13304 367 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 MYBPC2Q14324 1141 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 SLC39A14Q15043 492 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 TAF12Q16514 161 aa4.81□□□□□ -1.64
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