RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 E2F1Q01094 437 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 SLC10A7Q0GE19 358 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 CYP1B1Q16678 543 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 AP5B1Q2VPB7 878 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
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PTPRB-202ENST00000334414 MOB2Q70IA6 237 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRB-202ENST00000334414 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 CYP17A1P05093 508 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 NUDT7P0C024 238 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 SRCP12931 536 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 CLCA4Q14CN2 919 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 ATP6AP1Q15904 470 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 CERS6Q6ZMG9 384 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
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