RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRGCQ6NXR0 463 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPP5Q8N3R9 675 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRK7Q8WTQ7 553 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFPM2Q8WW38 1151 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELMO1Q92556 727 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFSD3Q96ES6 412 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC1Q99614 292 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPNE5Q9HCH3 593 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNA1GO43497 2377 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5K3A6NET4 321 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 FANCGO15287 622 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR56A5P0C7T3 313 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFS1P28331 727 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD151P48509 253 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 UCNP55089 124 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXADRP78310 365 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL35Q6PF15 583 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CES3Q6UWW8 571 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM92BQ6ZTR7 304 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTX1Q86Y01 620 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC12Q96GR4 267 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC5A10A0PJK1 596 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASSF9O75901 435 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEPHS1P49903 392 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SARNPP82979 210 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF12Q5T6F0 453 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACHD1Q5VU97 1274 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAPRTQ6XQN6 538 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCUQ8NE86 351 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACVR1CQ8NER5 493 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPZA3Q96KX2 299 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINB12Q96P63 405 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTRCQ99895 268 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 APMAPQ9HDC9 416 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO8Q9NRD0 319 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA5BQ9P283 1151 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANAPC5Q9UJX4 755 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 STMND1H3BQB6 276 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8MH3BSY2 632 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 MLNP12872 115 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGB6P18564 788 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEA3P43357 314 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTPAP49638 278 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT33BQ14525 404 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYTL3Q4VX76 610 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMC3Q5W041 872 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF449Q6P9G9 518 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 OOSP2Q86WS3 158 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CREG2Q8IUH2 290 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAT8LQ8N9F0 302 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL6Q8WZ60 621 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO2A1Q92959 643 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 FERD3LQ96RJ6 166 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 MVB12BQ9H7P6 319 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 HRASLS2Q9NWW9 162 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGAQ8IWI9 3026 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC400499M0QZD8 3231 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6C74A6NCV1 312 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 VAPBO95292 243 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACADLP28330 430 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCR7P32248 378 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3BP2P78314 561 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTK6Q13882 451 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRD3Q15059 726 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R7Q15435 360 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEACAM20Q6UY09 585 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR155Q7Z3F1 870 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHC3Q8NDX5 983 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52E1Q8NGJ3 308 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD180Q99467 661 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRTNQ99748 197 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 HGH1Q9BTY7 390 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RY12Q9H244 342 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms