RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326181.10

TRAF7-201, Transcript of TNF receptor associated factor 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF7, Length 3,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7-201ENST00000326181 SEPT3Q9UH03 358 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF682O95780 498 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 HTR1BP28222 390 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 AQP6Q13520 282 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 DENND1CQ8IV53 801 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 MYOCQ99972 504 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 ACTL8Q9H568 366 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PKP3Q9Y446 797 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PFDN6O15212 129 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TULP3O75386 442 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 DIRAS1O95057 198 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 GGT1P19440 569 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 AKT1P31749 480 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PWP1Q13610 501 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TSPEARQ8WU66 669 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 M0R3G1 203 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 STX16O14662 325 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 INSIG1O15503 277 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 SEC14L2O76054 403 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 SEMG2Q02383 582 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 CYP4F3Q08477 520 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 GALNT10Q86SR1 603 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 LIX1Q8N485 282 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 LEMD2Q8NC56 503 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TAMM41Q96BW9 452 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 ULK4Q96C45 1275 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 NODALQ96S42 347 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 CXCR6O00574 342 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 LRATO95237 230 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 CPNE6O95741 557 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TSPAN12O95859 305 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 B3GALT4O96024 378 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PSMB9P28065 219 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 IDUAP35475 653 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 MAP2K4P45985 399 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 DNASE1L3Q13609 305 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 WWOXQ9NZC7 414 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 AXIN1O15169 862 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 SERPINA1P01009 418 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 SLC6A4P31645 630 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TTPAP49638 278 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 EID3Q8N140 333 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 OR52E6Q96RD3 313 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 POLE4Q9NR33 117 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 INHBBP09529 407 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 JAK1P23458 1154 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 CARTPTQ16568 116 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PDPRQ8NCN5 879 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF7-201ENST00000326181 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms