RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 PERM1Q5SV97 790 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 97
HOXD4-201ENST00000306324 KCNJ9Q92806 393 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC74AQ96AQ1 378 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PPM1DO15297 605 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 GPC4O75487 556 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 FASLGP48023 281 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 VRK3Q8IV63 474 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB2Q8N680 514 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 GPR21Q99679 349 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CPNE1Q99829 537 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 SPTBN2O15020 2390 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 VPS26AO75436 327 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 RFPL3O75679 317 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CLCN7P51798 805 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PPM1JQ5JR12 505 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PDZD3Q86UT5 571 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 AVL9Q8NBF6 648 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CYTH2Q99418 400 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC3Q9BQI4 270 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 POT1Q9NUX5 634 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CDYLQ9Y232 598 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 MED16Q9Y2X0 877 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SAT1P21673 171 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 GP5P40197 560 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 KRT33BQ14525 404 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 WDR93Q6P2C0 686 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SLC22A15Q8IZD6 547 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 VPS39Q96JC1 886 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SLC30A3Q99726 388 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 RHOJQ9H4E5 214 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R13Q9NYV9 303 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD12Q6UB98 2062 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SLCO2B1O94956 709 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 GP1BAP07359 652 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 MCM3P25205 808 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ALDH4A1P30038 563 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 CDKN2DP55273 166 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ILKQ13418 452 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 NAB1Q13506 487 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TTLL9Q3SXZ7 439 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 FAM45BPQ6NSW5 357 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 UGT3A1Q6NUS8 523 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 GIMAP7Q8NHV1 300 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 FAM45AQ8TCE6 357 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SH3KBP1Q96B97 665 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SLC38A3Q99624 504 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ABCG4Q9H172 646 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 LATS2Q9NRM7 1088 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 VWA7Q9Y334 891 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 RIPK2O43353 540 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 FAM155BO75949 473 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PNLIPP16233 465 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PIM3Q86V86 326 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 SPNS2Q8IVW8 549 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 PHC3Q8NDX5 983 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP61Q8NHU2 1237 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD4-201ENST00000306324 CD200R1Q8TD46 325 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms