RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222402.7

UBE2D4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 D4 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2D4, Length 3,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4-201ENST00000222402 NTRK1P04629 796 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 GJA1P17302 382 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 EMX2Q04743 252 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TSPEARQ8WU66 669 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TMBIM1Q969X1 311 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 RAP2AP10114 183 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 SGSHP51688 502 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CYP4F3Q08477 520 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TPD52L3Q96J77 140 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 MYRFLQ96LU7 910 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 DEFB118Q96PH6 123 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 SCN3BQ9NY72 215 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CD300AQ9UGN4 299 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 C3orf18Q9UK00 162 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TRIM17Q9Y577 477 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 A0A1B0GTL3 188 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 A0A1B0GTW7 788 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 M0R3G1 203 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 DFNA5O60443 496 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TULP3O75386 442 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 KLKB1P03952 638 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 SMIM18P0DKX4 95 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 COX7A2P14406 83 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 PWP1Q13610 501 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 MBTPS1Q14703 1052 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 ZNF284Q2VY69 593 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 HPS4Q9NQG7 708 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 C8orf4Q9NR00 106 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 USP22Q9UPT9 525 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 MGAT4DA6NG13 374 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 H0YJX3 145 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 RFC2P35250 354 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CLCN4P51793 760 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 LAPTM5Q13571 262 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 RCAN2Q14206 197 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 SZRD1Q7Z422 152 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 STON2Q8WXE9 905 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TMEM159Q96B96 161 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 PANX1Q96RD7 426 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 RNF208Q9H0X6 261 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CD320Q9NPF0 282 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 C1orf109Q9NX04 203 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 SPASTQ9UBP0 616 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 MYO7AQ13402 2215 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CDH1P12830 882 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 NEK2P51955 445 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 ABRQ12979 859 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 FATE1Q969F0 183 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TEX37Q96LM6 180 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 BBS2Q9BXC9 721 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 RNF38Q9H0F5 515 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 PLOD2O00469 737 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 MTX2O75431 263 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CYP4B1P13584 511 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 NFATC2Q13469 925 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 OGFOD2Q6N063 350 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TERB1Q8NA31 727 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 LEMD2Q8NC56 503 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 DPF3Q92784 378 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CASD1Q96PB1 797 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 IL17CQ9P0M4 197 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CXCR6O00574 342 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 PGLSO95336 258 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 NR4A1P22736 598 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 HMGCLP35914 325 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 DAG1Q14118 895 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 IHHQ14623 411 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2D4-201ENST00000222402 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms