RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218652.11

NDFIP2-201, Transcript of Nedd4 family interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDFIP2, Length 4,625 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2-201ENST00000218652 CD247P20963 164 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 ARFIP1P53367 373 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 PLA2G16P53816 162 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 LILRA4P59901 499 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 TSPAN5P62079 268 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 PCED1BQ96HM7 432 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 C1orf109Q9NX04 203 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF536O15090 1300 aa14.77□□□□□ -0.04
NDFIP2-201ENST00000218652 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 S100GP29377 79 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PRDX6P30041 224 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PDPRQ8NCN5 879 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 TSPAN4O14817 238 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 SCAMP1O15126 338 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 MED27Q6P2C8 311 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.77□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 KAT6AQ92794 2004 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 MID1O15344 667 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PRKD3O94806 890 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 GADD45GO95257 159 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 MATN4O95460 622 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PRPS2P11908 318 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 ATF6P18850 670 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PAX3P23760 479 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 IGFALSP35858 605 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 CLCNKBP51801 687 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 MERTKQ12866 999 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 C10orf82Q8WW14 230 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 HMCESQ96FZ2 354 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PADI3Q9ULW8 664 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 DERAQ9Y315 318 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 CCNB2O95067 398 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF12P17014 697 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 BNIP3Q12983 259 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PYCR2Q96C36 320 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 CHIAQ9BZP6 476 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC7A4O43246 635 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 ORC5O43913 435 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 LMO2P25791 158 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 FMO3P31513 532 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.76□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 OR1F1O43749 312 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 DNAJA2O60884 412 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 CD36P16671 472 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 IDSP22304 550 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 TIE1P35590 1138 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 GNALP38405 381 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 CDH4P55283 916 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 HMGCS1Q01581 520 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 IFI44LQ53G44 452 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 SUN5Q8TC36 379 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 FATE1Q969F0 183 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 RAP2AP10114 183 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 ALAS2P22557 587 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 CCR10P46092 362 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 SULT2A1Q06520 285 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 TREML2Q5T2D2 321 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 NKD1Q969G9 470 aa14.75□□□□□ -0.05
NDFIP2-201ENST00000218652 ARMC5Q96C12 935 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms