RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022197.14

Scamp1-201, Transcript of Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scamp1, Length 4,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Abcb9Q9JJ59 762 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Angptl2Q9R045 493 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 ClockO08785 855 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Gm5460Q3UQ97 254 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 MyrfQ3UR85 1138 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Slc10a7Q5PT53 340 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Sema4aQ62178 760 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 ApofQ91V80 315 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Q91W34 466 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 DlstQ9D2G2 454 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Tex22Q9D9U4 189 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Olfr704Q9EPF6 315 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Panx1Q9JIP4 426 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Psma4Q9R1P0 261 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Trpm6Q8CIR4 2028 aa14.64□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Vmn2r24D3YUI0 854 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Mkrn2osD3Z393 217 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Q3UTZ3 580 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 IpmkQ7TT16 396 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Trim31Q8R0K2 507 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 HnrnprQ8VHM5 632 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Itfg1Q99KW9 610 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Ifi44lQ9BDB7 447 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Ssr2Q9CPW5 183 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Q9CQF4 240 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 ProzQ9CQW3 399 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Cxxc1Q9CWW7 660 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Glod5Q9D8I3 148 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Il22bQ9JJY8 179 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 St6galnac1Q9QZ39 526 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Slc27a6E9Q9W4 619 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 St3gal1P54751 337 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Rps7P62082 194 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Mapk1P63085 358 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Trappc9Q3U0M1 1148 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Rab3ipQ68EF0 428 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Kirrel1Q80W68 789 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Fam72aQ8BFZ8 149 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Phf11aQ8BVM9 293 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Olfr394Q8VGR5 310 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Slc3a1Q91WV7 685 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 PrepQ9QUR6 710 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Gm3594E9Q2A7 267 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 BC049352E9Q2Z6 85 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Vmn1r76F8VQ63 324 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Mtnd4P03911 459 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 LdlrP35951 862 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 KdsrQ6GV12 332 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Kxd1Q80XH1 177 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Ubash3bQ8BGG7 638 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Tyw3Q8BSA9 257 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Asb14Q8C6Y6 587 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Fads1Q920L1 447 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Bbs2Q9CWF6 721 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Kdelc1Q9JHP7 502 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 C4bpaP08607 469 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 GckP52792 465 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Mtf2Q02395 593 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Pag1Q3U1F9 429 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Olfr1325Q8VF43 315 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Olfr659Q8VGV6 322 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Spred2Q924S7 410 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Nmd3Q99L48 503 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Lrrc4Q99PH1 652 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Ppp6cQ9CQR6 305 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Hnrnpa0Q9CX86 305 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Sppl2aQ9JJF9 523 aa14.63□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Gnpda1O88958 289 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Cd2P08920 344 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Bpifa1P97361 278 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Cdk15Q3V3A1 433 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Taar7eQ5QD09 358 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Otub1Q7TQI3 271 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Plekhs1Q8BW88 474 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Kat2aQ9JHD2 830 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Greb1lB9EJV3 1913 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Scn11aQ9R053 1765 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Gm8011K7N6Y5 207 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Ebf2O08792 575 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Dnajb3O35723 242 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 NfycP70353 335 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Q14AM7 275 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Kcna7Q17ST2 489 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Zc3hav1Q3UPF5 946 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Syce1lQ5D525 247 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Fam46cQ5SSF7 391 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Ptx4Q6RUU0 478 aa14.62□□□□□ -0.07
Scamp1-201ENSMUST00000022197 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.7 ms