RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 CYP1B1Q16678 543 aa21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 KLHL35Q6PF15 583 aa21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CERS6Q6ZMG9 384 aa21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CHD6Q8TD26 2715 aa21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 GRK7Q8WTQ7 553 aa21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa21.88■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 EFCAB7A8K855 629 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 PRAMEF10O60809 474 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 TCP1P17987 556 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 GPR150Q8NGU9 434 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ZDHHC12Q96GR4 267 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 TAAR9Q96RI9 348 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 COG4Q9H9E3 785 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ADAMTS20P59510 1910 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CTAGE9A4FU28 777 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 PHF2O75151 1096 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 OR56A5P0C7T3 313 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CAPZBP47756 277 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 GFERP55789 205 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CRADDP78560 199 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 PACS1Q6VY07 963 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ART4Q93070 314 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 SGSM3Q96HU1 749 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 TGM7Q96PF1 710 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 B3GNT4Q9C0J1 378 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 SLC39A1Q9NY26 324 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 OGFRQ9NZT2 677 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 B4E171 279 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 RASSF9O75901 435 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 FTH1P02794 183 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 MGAT1P26572 445 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CD82P27701 267 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 NDUFS1P28331 727 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 TSPAN7P41732 249 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 FNTAP49354 379 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 UCNP55089 124 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 IRGCQ6NXR0 463 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 RSC1A1Q92681 617 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CATSPERZQ9NTU4 200 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 OCIAD1Q9NX40 245 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ACSL6Q9UKU0 697 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 PRSS21Q9Y6M0 314 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 C9orf172C9J069 976 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 C9P02748 559 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 RAB15P59190 212 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 KCNJ11Q14654 390 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ZNF534Q76KX8 674 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 PDZD3Q86UT5 571 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 C9orf72Q96LT7 481 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 FOXJ2Q9P0K8 574 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 SAR1BQ9Y6B6 198 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 RPA4Q13156 261 aa21.84■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 DCAF12Q5T6F0 453 aa21.84■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ELMO1Q92556 727 aa21.84■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CRELD1Q96HD1 420 aa21.84■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 TREX1Q9NSU2 369 aa21.84■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 SYBUQ9NX95 663 aa21.84■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 OR1I1O60431 355 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD34CP0C6C1 535 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 LIPCP11150 499 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 NMBRP28336 390 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 MAGEA6P43360 314 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 TMPRSS3P57727 454 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CXADRP78310 365 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CLN3Q13286 438 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 PPP1R7Q15435 360 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CASC4Q6P4E1 433 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 XKR5Q6UX68 686 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 OTUD6BQ8N6M0 293 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 CPT1BQ92523 772 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-210ENST00000641643 KIFC1Q9BW19 673 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms