RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 H0Y858 1186 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MAGEC1O60732 1142 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PGLSO95336 258 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 COL6A2P12110 1019 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 SRCP12931 536 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 SQLEQ14534 574 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MYLK3Q32MK0 819 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 FAM26DQ5JW98 314 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 RDH11Q8TC12 318 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MGME1Q9BQP7 344 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 Q9H521 79 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 GID8Q9NWU2 228 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 ASF1AQ9Y294 204 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MYO10Q9HD67 2058 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 DRGXA6NNA5 263 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 FKBP6O75344 327 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 STK16O75716 305 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 OR6B1O95007 311 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PCCBP05166 539 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 CAPN3P20807 821 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 CD72P21854 359 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PPM1AP35813 382 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 SLC6A11P48066 632 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 DGKGP49619 791 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 VAC14Q08AM6 782 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MESP2Q0VG99 397 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 CHIT1Q13231 466 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 SPIDRQ14159 915 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 GPRC6AQ5T6X5 926 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 CLEC14AQ86T13 490 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 STK40Q8N2I9 435 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 LIX1Q8N485 282 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 JADE3Q92613 823 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 EID2BQ96D98 161 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 EGLN2Q96KS0 407 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 OR52E6Q96RD3 313 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 USP34Q70CQ2 3546 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PTPN2P17706 415 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PTNP21246 168 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PRKACGP22612 351 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 SATB1Q01826 763 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 LIPEQ05469 1076 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 TUBB3Q13509 450 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PDK3Q15120 406 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 NEDD8Q15843 81 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 TPGS2Q68CL5 300 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 CBR4Q8N4T8 237 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 CD200R1Q8TD46 325 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 CCT7Q99832 543 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 INVSQ9Y283 1065 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 INSL6Q9Y581 213 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 TMEM202A6NGA9 273 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 MAP3K13O43283 966 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 NOBOXO60393 691 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 TRBC1P01850 177 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 TIE1P35590 1138 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 CPOXP36551 454 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PTGER3P43115 390 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 PRKAG1P54619 331 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-217ENST00000628904 SMARCB1Q12824 385 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms