RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 ANKS6Q68DC2 871 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 C17orf99Q6UX52 265 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 LINGO4Q6UY18 593 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SERINC5Q86VE9 423 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF683Q8IZ20 524 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ANKFN1Q8N957 763 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 TOP1MTQ969P6 601 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 CD274Q9NZQ7 290 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 MED16Q9Y2X0 877 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SDK1Q7Z5N4 2213 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC154A6NI56 674 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 CLDN25C9JDP6 229 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 C1RP00736 705 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ASGR1P07306 291 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SERPINF2P08697 491 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 DDX5P17844 614 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 TGM1P22735 817 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 IL12AP29459 219 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 OR4D2P58180 307 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 IFITM3Q01628 133 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SERINC3Q13530 473 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 CRY1Q16526 586 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 CEP78Q5JTW2 689 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 UBE2UQ5VVX9 321 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 KANK2Q63ZY3 851 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 AKAP14Q86UN6 197 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 STAG3L4Q8TBR4 150 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ZMYM5Q9UJ78 669 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 CBX4O00257 560 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 CCRL2O00421 344 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 TMCC2O75069 709 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 GUCA1CO95843 209 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 CNPP09543 421 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ELK4P28324 431 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 HTR6P50406 440 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SELPLGQ14242 412 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF846Q147U1 533 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 CTXN3Q4LDR2 81 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 FAM171A1Q5VUB5 890 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 NADSYN1Q6IA69 706 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 MDGA1Q8NFP4 955 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 OSCP1Q8WVF1 389 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SGCDQ92629 289 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM125Q96AQ2 219 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 TAS2R13Q9NYV9 303 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 FKBPLQ9UIM3 349 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 Q9Y3F1 56 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 GPR45Q9Y5Y3 372 aa10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 MIA3Q5JRA6 1907 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 TAF4O00268 1085 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 NUAK1O60285 661 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SNX2O60749 519 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 HOXC8P31273 242 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 VEGFBP49765 207 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 GATMP50440 423 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 CHRNEQ04844 493 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SGO1Q5FBB7 561 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ANKRD34AQ69YU3 496 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 KCTD8Q6ZWB6 473 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ABHD11Q8NFV4 315 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 BRSK1Q8TDC3 778 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 LINGO1Q96FE5 620 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 BTN2A3PQ96KV6 586 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 C1orf74Q96LT6 269 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.53□□□□□ -0.72
FCHO1-216ENST00000596536 SCML2Q9UQR0 700 aa10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms