RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	WDR93	Q6P2C0	686 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CNST	Q6PJW8	725 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ARL14	Q8N4G2	192 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	KY	Q8NBH2	561 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	MAPK15	Q8TD08	544 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	KCNJ9	Q92806	393 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	IQCF5	A8MTL0	148 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	DKK1	O94907	266 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	APOA4	P06727	396 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	TUBB	P07437	444 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	MCM3	P25205	808 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ID4	P47928	161 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ACADVL	P49748	655 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	NR1D2	Q14995	579 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	TMED2	Q15363	201 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	FBF1	Q8TES7	1133 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	PATE1	Q8WXA2	126 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM159	Q96B96	161 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CYTH2	Q99418	400 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CPNE1	Q99829	537 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	UCK1	Q9HA47	277 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	POT1	Q9NUX5	634 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CDYL	Q9Y232	598 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900		E5RI56	91 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ZW10	O43264	779 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	NIPSNAP2	O75323	286 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SLCO2B1	O94956	709 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ABHD2	P08910	425 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	FAM153B	P0C7A2	387 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	MYBL2	P10244	700 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CHRM3	P20309	590 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	NDUFS1	P28331	727 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ATP5D	P30049	168 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SLC19A1	P41440	591 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	GPR3	P46089	330 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CLCN7	P51798	805 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	E2F1	Q01094	437 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	DNAJC3	Q13217	504 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	GBX1	Q14549	363 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CLCA4	Q14CN2	919 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	RPE65	Q16518	533 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	FAM153C	Q494X1	144 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SYTL3	Q4VX76	610 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	GUSBP11	Q6P575	273 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	PDZD3	Q86UT5	571 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	KRT222	Q8N1A0	295 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	IFI44	Q8TCB0	444 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	WWP1	Q9H0M0	922 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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