RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.12□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.12□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.12□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 STK17BO94768 372 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 GAS8O95995 478 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 IFNB1P01574 187 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ITGB2P05107 769 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 POLBP06746 335 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 LIFP15018 202 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ACRV1P26436 265 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 FDFT1P37268 417 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CACNG1Q06432 222 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 STYXQ8WUJ0 223 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SPRY4Q9C004 299 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 E7EVH7 732 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 LMAN1P49257 510 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CDH17Q12864 832 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SNX1Q13596 522 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 KRT33BQ14525 404 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 XKR5Q6UX68 686 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 UBXN4Q92575 508 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 EXTL1Q92935 676 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 MED8Q96G25 268 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 OR6C1Q96RD1 312 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.1□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC78A2IDD5 438 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 OR5K3A6NET4 321 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 MROH6A6NGR9 719 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 KIF5CO60282 957 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SUN1O94901 812 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 DLGAP3O95886 979 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 PRSS56P0CW18 603 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFS1P28331 727 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 PPP1CAP62136 330 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SH3BP2P78314 561 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CYP4F2P78329 520 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ABHD18Q0P651 414 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 LAMB3Q13751 1172 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 IL11RAQ14626 422 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 DBN1Q16643 649 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 OOSP2Q86WS3 158 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ESX1Q8N693 406 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC89Q8N998 374 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 CD180Q99467 661 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 COG4Q9H9E3 785 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms