RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559937.1

SMAD3-212, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-212ENST00000559937 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 OPTCQ9UBM4 332 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 DHRS12A0PJE2 317 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 SERTM1A2A2V5 107 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ASPDHA6ND91 283 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF839A8K0R7 811 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 K7EPI3 171 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 KIAA0355O15063 1070 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 KPNA5O15131 536 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ARPC2O15144 300 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 SLC16A5O15375 505 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 TAPBPO15533 448 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 KATNA1O75449 491 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 FGF18O76093 207 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 TIMP1P01033 207 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 C8AP07357 584 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 C8GP07360 202 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 CAPN1P07384 714 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 OR56A5P0C7T3 313 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 EBLN1P0CF75 366 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 SMIM18P0DKX4 95 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF30P17039 623 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 PSMC3P17980 439 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 NFKBIAP25963 317 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 CD70P32970 193 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 GGT5P36269 586 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 GRIA3P42263 894 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 GJA8P48165 433 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 GSK3BP49841 420 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 EPHA5P54756 1037 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 DCDC1P59894 354 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 UFM1P61960 85 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 SP140Q13342 867 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 PTPRRQ15256 657 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 NR6A1Q15406 480 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 CARD16Q5EG05 197 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 TBCELQ5QJ74 424 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 RNF220Q5VTB9 566 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 HID1Q8IV36 788 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 SFRP1Q8N474 314 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 SNX31Q8N9S9 440 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 LEMD2Q8NC56 503 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 TRPV3Q8NET8 790 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 CANT1Q8WVQ1 401 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 COPS8Q99627 209 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 EGFL8Q99944 293 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 BOCQ9BWV1 1114 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ALG2Q9H553 416 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 IPPKQ9H8X2 491 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ASAH2Q9NR71 780 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 SMOXQ9NWM0 555 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 WWOXQ9NZC7 414 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 LZTS1Q9Y250 596 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMAD3-212ENST00000559937 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms