RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	LHCGR	P22888	699 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ACTR1B	P42025	376 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CHRNA4	P43681	627 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	GFER	P55789	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ACTR1A	P61163	376 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	OLIG2	Q13516	323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ACOX1	Q15067	660 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	AGER	Q15109	404 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CNGA3	Q16281	694 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222		A6NCN8	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	KIAA0754	O94854	1291 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SUN1	O94901	812 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TIAF1	O95411	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ELFN1	P0C7U0	828 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PIRT	P0C851	137 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ZNF30	P17039	623 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SEPHS1	P49903	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PGD	P52209	483 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	DR1	Q01658	176 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	GPS1	Q13098	491 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ESX1	Q8N693	406 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CT55	Q8WUE5	264 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222		E7EVH7	732 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PSMD11	O00231	422 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CREG1	O75629	220 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CLDN7	O95471	211 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CBX6	O95503	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	APRT	P07741	180 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	MAGEA6	P43360	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	VPS41	P49754	854 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	STC1	P52823	247 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PTS	Q03393	145 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	C2orf54	Q08AI8	447 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	RAPSN	Q13702	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PTK6	Q13882	451 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	LINC00523	Q86TU6	105 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	KRT12	Q99456	494 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TRABD	Q9H4I3	376 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	APC	P25054	2843 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222		A6NL46	340 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TTI1	O43156	1089 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	KEL	P23276	732 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CDK3	Q00526	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CDK16	Q00536	496 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	DNASE1L3	Q13609	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	IL10RA	Q13651	578 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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