RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 CYP4X1Q8N118 509 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 DEFB119Q8N690 84 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 RDH11Q8TC12 318 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CD200R1Q8TD46 325 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PIGKQ92643 395 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TLCD1Q96CP7 247 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 APOPT1Q96IL0 206 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 VPS11Q9H270 941 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 FGF22Q9HCT0 170 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SUFUQ9UMX1 484 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 H0Y8X5 98 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 SGTAO43765 313 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ZBTB14O43829 449 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 EPN2O95208 641 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CCDC166P0CW27 439 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 BRAFP15056 766 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 JUNDP17535 347 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 HIST1H2ADP20671 130 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ITPKAP23677 461 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 MAOBP27338 520 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 NDUFS1P28331 727 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CCR7P32248 378 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CA5AP35218 305 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 RXRGP48443 463 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ASPHQ12797 758 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 GBX1Q14549 363 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ALG11Q2TAA5 492 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CLEC14AQ86T13 490 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CEP97Q8IW35 865 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 RAB42Q8N4Z0 105 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 BANPQ8N9N5 519 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CCDC126Q96EE4 140 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 OLFM1Q99784 485 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 COG4Q9H9E3 785 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 MED16Q9Y2X0 877 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PPM1 405 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 LRP3O75074 770 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CER1O95813 267 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 SYF2O95926 243 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CATP04040 527 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 TAC1P20366 129 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CYP2A7P20853 494 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 HSD17B2P37059 387 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CTSKP43235 329 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ABCG1P45844 678 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 PRKAA2P54646 552 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 AP1S2P56377 157 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CTBSQ01459 385 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms