RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CRHR2Q13324 411 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 QPRTQ15274 297 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 IFI44LQ53G44 452 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DEF8Q6ZN54 512 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MOB2Q70IA6 237 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 FAR1Q8WVX9 515 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 REP15Q6BDI9 236 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 AADACL2Q6P093 401 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 UPB1Q9UBR1 384 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MKS1Q9NXB0 559 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ING4Q9UNL4 249 aa8.38□□□□□ -1.07
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